[关键词]
[摘要]
结瘤素(nodulin, NOD)是一类主要存在于根瘤细胞中并参与共生固氮作用的植物基因产物,在豆科植物的其他组织细胞中以及非豆科植物体内都有发现。为了探究NOD基因在中华猕猴桃这类非豆科植物中的生物学功能,本研究采用一系列生物信息学方法对其序列特征进行分析,再对其编码蛋白进行理化性质分析、保守域预测、二三级结构预测、亚细胞定位和磷酸化分析,最后与不同植物中的NOD蛋白构建系统发育树。研究结果显示:该基因编码蛋白的氨基酸残基数为94个,蛋白质的分子式为C432H715N131O120S3,分子量为9.76041kD,蛋白等电点pI为10.68,属于疏水蛋白。带正电的残基(Arg+Lys)11个,带负电的残基(Asp+Glu)3个,不稳定系数为14.00,脂肪系数为107.23,总平均亲水性系数为0.395;AcNOD蛋白含有一个ENOD93保守结构域;二级结构显示该蛋白主要有59.57%α-螺旋、17.02%的无规卷曲、15.96%的延伸链和7.45%的β-转角所组成;三级结构的预测结果显示该蛋白扭曲和折叠较多,亚细胞定位于内质网中,存在4个糖基化位点的12个磷酸化位点,不存在信号肽序列,有两个跨膜区域。进化树分析表明该蛋白与豆科植物结瘤素的同源性很高,初步推测他们有相似或相同的功能。结果为后续深入了解NOD基因在中华猕猴桃乃至其他非豆科植物中的作用机制和生物学功能提供基础资料。
[Key word]
[Abstract]
[中图分类号]
[基金项目]
国家自然科学基金项目(面上项目,重点项目,重大项目)云南省农业基础研究联合专项基金